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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.4068Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 207 / 3259021 73 / 403641 373 / 25718729 14 / 491920 207 / 3259021 73 / 403641 373 / 25718729 14 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 -- 3 / 103390 -- 2 / 100926 -- 3 / 103390 --
brain 21 / 261599   93 / 7554651 -- 21 / 261599 0 / 2128 93 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 3 / 233710   5 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum 46 / 228104 -- -- -- 46 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 6 / 39315 -- -- -- 6 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 27 / 718928 2 / 9837 39 / 2760977 -- 27 / 718928 2 / 9837 39 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 2 / 138066 -- 2 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 13 / 548222 -- 1 / 34979 -- 13 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 17 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 17 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   16 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 16 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 21 / 595880 -- 1 / 16187 -- 21 / 595880 --
liver 10 / 104633   1 / 527425 -- 10 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 3 / 26861 11 / 72516 12 / 943009 -- 3 / 26861 11 / 72516 12 / 943009 --
lymph node   -- 3 / 344354 -- 0 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   45 / 216846 10 / 960632 3 / 178606 0 / 85464 45 / 216846 10 / 960632 3 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     16 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 16 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 4 / 145854 -- 0 / 17986 -- 4 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 4 / 292212 -- 1 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate     13 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 13 / 386047 --
retina 6 / 82470 -- 11 / 636203 -- 6 / 82470 -- 11 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434 3 / 958 -- -- 1 / 18434 3 / 958 -- --
skin 10 / 85891 5 / 31511 8 / 615945 2 / 57574 10 / 85891 5 / 31511 8 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492 2 / 17831 4 / 386635 -- 2 / 73492 2 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- -- 5 / 234473 -- -- -- 5 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 5 / 218318 -- 3 / 21241 -- 5 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   4 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus 1 / 100203   5 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 5 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 32 / 262740 5 / 14058   -- 32 / 262740 5 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 37 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 37 / 1092595 --
white blood cells -- -- 14 / 398838 -- -- -- 14 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 9 / 212613 -- -- 2 / 531904 9 / 212613