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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.401070Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 4 / 3259021   183 / 25718729 7 / 491920 4 / 3259021 0 / 403641 183 / 25718729 7 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 2 / 64924 -- 0 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     25 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 25 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 2 / 233710   0 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue     29 / 2760977 -- 0 / 718928 0 / 9837 29 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   -- 1 / 138066 -- 0 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 3 / 548222 -- 0 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart   -- 12 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 12 / 1231698 --
kidney     17 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 17 / 1415985 --
limb   -- 4 / 595880 -- 0 / 16187 -- 4 / 595880 --
liver     3 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung     19 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 19 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     7 / 960632 5 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 7 / 960632 5 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 5 / 354066 -- 0 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas     7 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 7 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina   -- 6 / 636203 -- 0 / 82470 -- 6 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     9 / 615945 1 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 9 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     5 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 5 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     6 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 6 / 736319 --
thymus     6 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 6 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740   1 / 25954 -- 1 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 4 / 206823 -- 0 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular   -- 2 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 2 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 1 / 212613 -- -- 2 / 531904 1 / 212613