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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.40020Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 159 / 3259021 40 / 403641 88 / 25718729 2 / 491920 159 / 3259021 40 / 403641 88 / 25718729 2 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 23 / 261599   27 / 7554651 -- 23 / 261599 0 / 2128 27 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 1 / 233710   5 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 23 / 228104 -- -- -- 23 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 11 / 39315 -- -- -- 11 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 26 / 718928 2 / 9837 6 / 2760977 -- 26 / 718928 2 / 9837 6 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 8 / 94929 --   -- 8 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 4 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 4 / 1231698 --
kidney 2 / 121184   2 / 1415985 -- 2 / 121184 0 / 2215 2 / 1415985 --
limb   -- 3 / 595880 -- 0 / 16187 -- 3 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung 1 / 26861 10 / 72516 6 / 943009 -- 1 / 26861 10 / 72516 6 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 2 / 344354 -- 2 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   26 / 216846 5 / 960632   0 / 85464 26 / 216846 5 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     5 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 5 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 4 / 636203 -- 2 / 82470 -- 4 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891 2 / 31511 9 / 615945 2 / 57574 6 / 85891 2 / 31511 9 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492   1 / 386635 -- 4 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987     -- 2 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus 15 / 100203   1 / 346181 -- 15 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 16 / 262740     -- 16 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 3 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- -- 4 / 398838 -- -- -- 4 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613