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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.391807Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 12 / 3259021   89 / 25718729   12 / 3259021 0 / 403641 89 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 2 / 261599   59 / 7554651 -- 2 / 261599 0 / 2128 59 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 5 / 228104 -- -- -- 5 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 4 / 718928   4 / 2760977 -- 4 / 718928 0 / 9837 4 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart   -- 3 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 3 / 1231698 --
kidney     1 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 1 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung     4 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 4 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland         0 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     1 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina   -- 4 / 636203 -- 0 / 82470 -- 4 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     2 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 2 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     1 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 1 / 100203   1 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue       -- 0 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613