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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.390355Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 157 / 3259021 7 / 403641 6275 / 25718729 3 / 491920 157 / 3259021 7 / 403641 6275 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 2 / 64924 -- 0 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 4 / 261599   86 / 7554651 -- 4 / 261599 0 / 2128 86 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 3 / 228104 -- -- -- 3 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 68 / 718928   18 / 2760977 -- 68 / 718928 0 / 9837 18 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 2 / 94929 --   -- 2 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart 33 / 49793 -- 5351 / 1231698 -- 33 / 49793 -- 5351 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb   -- 77 / 595880 -- 0 / 16187 -- 77 / 595880 --
liver 1 / 104633   55 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 55 / 527425 --
lung 1 / 26861 4 / 72516 28 / 943009 -- 1 / 26861 4 / 72516 28 / 943009 --
lymph node   -- 4 / 344354 -- 0 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464   3 / 960632   2 / 85464 0 / 216846 3 / 960632 0 / 178606
muscle 18 / 24130 -- 212 / 137075 -- 18 / 24130 -- 212 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 5 / 354066 -- 0 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas     252 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 252 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 1 / 145854 -- 2 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 5 / 37653 --   -- 5 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate     7 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 7 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     30 / 615945 1 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 30 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     56 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 56 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   -- 3 / 218318 -- 0 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   14 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 14 / 736319 --
thymus 1 / 100203 3 / 20273 11 / 346181 -- 1 / 100203 3 / 20273 11 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 6 / 262740     -- 6 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 7 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 7 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 42 / 531904 2 / 212613 -- -- 42 / 531904 2 / 212613