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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.390057Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 214 / 3259021 38 / 403641 238 / 25718729 11 / 491920 214 / 3259021 38 / 403641 238 / 25718729 11 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 35 / 100926 -- 2 / 103390 -- 35 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 10 / 261599   61 / 7554651 -- 10 / 261599 0 / 2128 61 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 6 / 233710   1 / 56549 -- 6 / 233710 0 / 43127
cerebrum 6 / 228104 -- -- -- 6 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 10 / 39315 -- -- -- 10 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 29 / 718928   17 / 2760977 -- 29 / 718928 0 / 9837 17 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 3 / 548222 -- 0 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 6 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 6 / 1231698 --
kidney 10 / 121184   14 / 1415985 -- 10 / 121184 0 / 2215 14 / 1415985 --
limb   -- 6 / 595880 -- 0 / 16187 -- 6 / 595880 --
liver   1 / 6685 4 / 527425 -- 0 / 104633 1 / 6685 4 / 527425 --
lung 3 / 26861 16 / 72516 2 / 943009 -- 3 / 26861 16 / 72516 2 / 943009 --
lymph node 6 / 14648 -- 3 / 344354 -- 6 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 18 / 216846 13 / 960632 4 / 178606 4 / 85464 18 / 216846 13 / 960632 4 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 2 / 137075 -- 2 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 6 / 35780 -- -- -- 6 / 35780 -- -- --
ovary   -- 2 / 354066 -- 0 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas 6 / 75220   4 / 1338446 -- 6 / 75220 0 / 34 4 / 1338446 --
pancreatic islet 5 / 30771 -- -- -- 5 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   3 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 13 / 82470 -- 12 / 636203 -- 13 / 82470 -- 12 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 4 / 85891 3 / 31511 10 / 615945 4 / 57574 4 / 85891 3 / 31511 10 / 615945 4 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 14 / 73492   5 / 386635 -- 14 / 73492 0 / 17831 5 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   23 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 23 / 736319 --
thymus 7 / 100203   6 / 346181 -- 7 / 100203 0 / 20273 6 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 21 / 262740     -- 21 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 1 / 206823 -- 1 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 12 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 12 / 1092595 --
white blood cells -- -- 13 / 398838 -- -- -- 13 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 3 / 212613 -- -- 4 / 531904 3 / 212613