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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.389924Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 8 / 3259021   102 / 25718729 2 / 491920 8 / 3259021 0 / 403641 102 / 25718729 2 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     16 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 16 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 5 / 718928   5 / 2760977 -- 5 / 718928 0 / 9837 5 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   -- 1 / 138066 -- 0 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 4 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 4 / 1231698 --
kidney 1 / 121184   3 / 1415985 -- 1 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb   -- 5 / 595880 -- 0 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung     5 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 5 / 943009 --
lymph node   -- 3 / 344354 -- 0 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     5 / 960632 2 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 5 / 960632 2 / 178606
muscle   -- 21 / 137075 -- 0 / 24130 -- 21 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 2 / 354066 -- 0 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas     3 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 3 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina   -- 1 / 636203 -- 0 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     10 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 10 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     1 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     1 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus     1 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue       -- 0 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 4 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 4 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904   -- -- 4 / 531904 0 / 212613