Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.389890Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 179 / 3259021 39 / 403641 498 / 25718729 10 / 491920 179 / 3259021 39 / 403641 498 / 25718729 10 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 4 / 38915 -- 1 / 64924 -- 4 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 1 / 103390 -- 1 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 1 / 261599   138 / 7554651 -- 1 / 261599 0 / 2128 138 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 2 / 233710   0 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum 13 / 228104 -- -- -- 13 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 5 / 51804   -- -- 5 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 25 / 718928   72 / 2760977 -- 25 / 718928 0 / 9837 72 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 6 / 138066 -- 2 / 94929 -- 6 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 6 / 548222 -- 0 / 34979 -- 6 / 548222 --
heart   -- 17 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 17 / 1231698 --
kidney 10 / 121184   21 / 1415985 -- 10 / 121184 0 / 2215 21 / 1415985 --
limb 6 / 16187 -- 16 / 595880 -- 6 / 16187 -- 16 / 595880 --
liver 43 / 104633   22 / 527425 -- 43 / 104633 0 / 6685 22 / 527425 --
lung   8 / 72516 11 / 943009 -- 0 / 26861 8 / 72516 11 / 943009 --
lymph node   -- 4 / 344354 -- 0 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 30 / 216846 44 / 960632 1 / 178606 2 / 85464 30 / 216846 44 / 960632 1 / 178606
muscle 8 / 24130 -- 5 / 137075 -- 8 / 24130 -- 5 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 3 / 354066 -- 0 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   23 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 23 / 1338446 --
pancreatic islet 7 / 30771 -- -- -- 7 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 4 / 145854 -- 1 / 17986 -- 4 / 145854 --
placenta   -- 25 / 292212 -- 0 / 37653 -- 25 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     11 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 11 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 2 / 636203 -- 3 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 5 / 85891   10 / 615945 4 / 57574 5 / 85891 0 / 31511 10 / 615945 4 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     5 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 5 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 6 / 116987   8 / 736319 -- 6 / 116987 0 / 2634 8 / 736319 --
thymus     3 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 27 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 -- 27 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 --
uterus   -- 4 / 206823 -- 0 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular   -- 19 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 19 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904 5 / 212613 -- -- 3 / 531904 5 / 212613