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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.389440Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 187 / 3259021 53 / 403641 3601 / 25718729 39 / 491920 187 / 3259021 53 / 403641 3601 / 25718729 39 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 7 / 38915 -- 3 / 64924 -- 7 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 16 / 100926 -- 7 / 103390 -- 16 / 100926 -- 7 / 103390 --
brain 7 / 261599   731 / 7554651 -- 7 / 261599 0 / 2128 731 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 30 / 233710 2 / 43127 0 / 56549 -- 30 / 233710 2 / 43127
cerebrum 18 / 228104 -- -- -- 18 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 63 / 718928   702 / 2760977 -- 63 / 718928 0 / 9837 702 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 43 / 211918 -- -- -- 43 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 17 / 138066 -- 4 / 94929 -- 17 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 133 / 548222 -- 0 / 34979 -- 133 / 548222 --
heart   -- 195 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 195 / 1231698 --
kidney 14 / 121184   182 / 1415985 -- 14 / 121184 0 / 2215 182 / 1415985 --
limb   -- 183 / 595880 -- 0 / 16187 -- 183 / 595880 --
liver 3 / 104633   65 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 65 / 527425 --
lung 2 / 26861 2 / 72516 140 / 943009 -- 2 / 26861 2 / 72516 140 / 943009 --
lymph node   -- 75 / 344354 -- 0 / 14648 -- 75 / 344354 --
lymphoreticular   2 / 5421 -- -- 0 / 3137 2 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 22 / 216846 81 / 960632 10 / 178606 3 / 85464 22 / 216846 81 / 960632 10 / 178606
muscle   -- 18 / 137075 -- 0 / 24130 -- 18 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 58 / 354066 -- 1 / 43149 -- 58 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   163 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 163 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 20 / 145854 -- 0 / 17986 -- 20 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 11 / 292212 -- 1 / 37653 -- 11 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   42 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 42 / 386047 --
retina 5 / 82470 -- 79 / 636203 -- 5 / 82470 -- 79 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891   86 / 615945 3 / 57574 1 / 85891 0 / 31511 86 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492 12 / 17831 32 / 386635 -- 3 / 73492 12 / 17831 32 / 386635 --
stem cell -- -- 44 / 234473 -- -- -- 44 / 234473 --
stomach   -- 60 / 218318 -- 0 / 21241 -- 60 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis     100 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 100 / 736319 --
thymus 1 / 100203 15 / 20273 59 / 346181 -- 1 / 100203 15 / 20273 59 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 18 / 262740   3 / 25954 -- 18 / 262740 0 / 14058 3 / 25954 --
uterus   -- 39 / 206823 -- 0 / 6854 -- 39 / 206823 --
vascular   -- 114 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 114 / 1092595 --
white blood cells -- -- 56 / 398838 -- -- -- 56 / 398838 --
whole body -- -- 30 / 531904 24 / 212613 -- -- 30 / 531904 24 / 212613