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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.38870Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 155 / 3259021   27 / 25718729 1 / 491920 155 / 3259021 0 / 403641 27 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 --   -- 1 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     4 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 4 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 --     2 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 11 / 39315 -- -- -- 11 / 39315 -- -- --
embryonic tissue     3 / 2760977 -- 0 / 718928 0 / 9837 3 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   -- 2 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 2 / 1231698 --
kidney 100 / 121184   3 / 1415985 -- 100 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb   -- 3 / 595880 -- 0 / 16187 -- 3 / 595880 --
liver 2 / 104633     -- 2 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung 1 / 26861   2 / 943009 -- 1 / 26861 0 / 72516 2 / 943009 --
lymph node   -- 1 / 344354 -- 0 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     1 / 960632   0 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 --   -- 2 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   1 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina   -- 1 / 636203 -- 0 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891       1 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 28 / 73492   1 / 386635 -- 28 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     1 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 3 / 262740     -- 3 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 1 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --   1 / 212613 -- -- 0 / 531904 1 / 212613