Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.388Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 111 / 3259021 6 / 403641 228 / 25718729 9 / 491920 111 / 3259021 6 / 403641 228 / 25718729 9 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     13 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 13 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 22 / 718928   13 / 2760977 -- 22 / 718928 0 / 9837 13 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye   -- 1 / 138066 -- 0 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract 18 / 34979 -- 3 / 548222 -- 18 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart   -- 6 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 6 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver 1 / 104633   4 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 4 / 527425 --
lung   3 / 72516 5 / 943009 -- 0 / 26861 3 / 72516 5 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 13 / 85464 3 / 216846 5 / 960632 6 / 178606 13 / 85464 3 / 216846 5 / 960632 6 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 5 / 354066 -- 0 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   9 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 9 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 22 / 37653 -- 87 / 292212 -- 22 / 37653 -- 87 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 2 / 636203 -- 1 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891   2 / 615945 2 / 57574 1 / 85891 0 / 31511 2 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     4 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach 3 / 21241 --   -- 3 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis     4 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus 6 / 100203   18 / 346181 -- 6 / 100203 0 / 20273 18 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 12 / 262740     -- 12 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 3 / 6854 -- 3 / 206823 -- 3 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 26 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 26 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 5 / 531904 1 / 212613 -- -- 5 / 531904 1 / 212613