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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.385020Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 146 / 3259021 27 / 403641 182 / 25718729   146 / 3259021 27 / 403641 182 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 3 / 261599   41 / 7554651 -- 3 / 261599 0 / 2128 41 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 6 / 56549 --     6 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 10 / 228104 -- -- -- 10 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 23 / 718928   26 / 2760977 -- 23 / 718928 0 / 9837 26 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 5 / 94929 --   -- 5 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 9 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 9 / 1231698 --
kidney 13 / 121184   6 / 1415985 -- 13 / 121184 0 / 2215 6 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 3 / 595880 -- 1 / 16187 -- 3 / 595880 --
liver 1 / 104633   1 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 3 / 26861 5 / 72516 5 / 943009 -- 3 / 26861 5 / 72516 5 / 943009 --
lymph node   -- 11 / 344354 -- 0 / 14648 -- 11 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland   19 / 216846 5 / 960632   0 / 85464 19 / 216846 5 / 960632 0 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 2 / 137075 -- 3 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 --   -- 2 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     6 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 6 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 1 / 145854 -- 3 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 4 / 292212 -- 1 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 8 / 636203 -- 2 / 82470 -- 8 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891 1 / 31511 3 / 615945   6 / 85891 1 / 31511 3 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen   1 / 17831 5 / 386635 -- 0 / 73492 1 / 17831 5 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach 2 / 21241 --   -- 2 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 17 / 116987   9 / 736319 -- 17 / 116987 0 / 2634 9 / 736319 --
thymus 14 / 100203   5 / 346181 -- 14 / 100203 0 / 20273 5 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 5 / 262740   1 / 25954 -- 5 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 3 / 206823 -- 1 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 18 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 18 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2 / 398838 -- -- -- 2 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904   -- -- 2 / 531904 0 / 212613