Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.384762Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 568 / 3259021 73 / 403641 1443 / 25718729 37 / 491920 568 / 3259021 73 / 403641 1443 / 25718729 37 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 12 / 38915 -- 2 / 64924 -- 12 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 10 / 100926 -- 2 / 103390 -- 10 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 82 / 261599   354 / 7554651 -- 82 / 261599 0 / 2128 354 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 7 / 56549 -- 23 / 233710 1 / 43127 7 / 56549 -- 23 / 233710 1 / 43127
cerebrum 31 / 228104 -- -- -- 31 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 151 / 718928 7 / 9837 210 / 2760977 -- 151 / 718928 7 / 9837 210 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 10 / 211918 -- -- -- 10 / 211918 --
eye 35 / 94929 -- 4 / 138066 -- 35 / 94929 -- 4 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 53 / 548222 -- 1 / 34979 -- 53 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 64 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 64 / 1231698 --
kidney 19 / 121184   50 / 1415985 -- 19 / 121184 0 / 2215 50 / 1415985 --
limb 3 / 16187 -- 47 / 595880 -- 3 / 16187 -- 47 / 595880 --
liver 4 / 104633   18 / 527425 -- 4 / 104633 0 / 6685 18 / 527425 --
lung 4 / 26861 22 / 72516 60 / 943009 -- 4 / 26861 22 / 72516 60 / 943009 --
lymph node 5 / 14648 -- 8 / 344354 -- 5 / 14648 -- 8 / 344354 --
lymphoreticular   2 / 5421 -- -- 0 / 3137 2 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 34 / 216846 37 / 960632 10 / 178606 1 / 85464 34 / 216846 37 / 960632 10 / 178606
muscle   -- 6 / 137075 -- 0 / 24130 -- 6 / 137075 --
nervous 12 / 35780 -- -- -- 12 / 35780 -- -- --
ovary 18 / 43149 -- 26 / 354066 -- 18 / 43149 -- 26 / 354066 --
pancreas 9 / 75220   61 / 1338446 -- 9 / 75220 0 / 34 61 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 3 / 145854 -- 3 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta   -- 2 / 292212 -- 0 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 14 / 99675 -- -- -- 14 / 99675 -- -- --
prostate     21 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 21 / 386047 --
retina 16 / 82470 -- 87 / 636203 -- 16 / 82470 -- 87 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 5 / 85891   35 / 615945 2 / 57574 5 / 85891 0 / 31511 35 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492 1 / 17831 35 / 386635 -- 8 / 73492 1 / 17831 35 / 386635 --
stem cell -- -- 18 / 234473 -- -- -- 18 / 234473 --
stomach   -- 23 / 218318 -- 0 / 21241 -- 23 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 11 / 116987   38 / 736319 -- 11 / 116987 0 / 2634 38 / 736319 --
thymus 22 / 100203 4 / 20273 38 / 346181 -- 22 / 100203 4 / 20273 38 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 76 / 262740 3 / 14058 7 / 25954 -- 76 / 262740 3 / 14058 7 / 25954 --
uterus   -- 12 / 206823 -- 0 / 6854 -- 12 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 57 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 57 / 1092595 --
white blood cells -- -- 12 / 398838 -- -- -- 12 / 398838 --
whole body -- -- 20 / 531904 24 / 212613 -- -- 20 / 531904 24 / 212613