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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.38445Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 321 / 3259021 102 / 403641 570 / 25718729 11 / 491920 321 / 3259021 102 / 403641 570 / 25718729 11 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 8 / 38915 -- 2 / 64924 -- 8 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 18 / 100926 -- 3 / 103390 -- 18 / 100926 -- 3 / 103390 --
brain 14 / 261599   57 / 7554651 -- 14 / 261599 0 / 2128 57 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 5 / 233710   2 / 56549 -- 5 / 233710 0 / 43127
cerebrum 11 / 228104 -- -- -- 11 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 81 / 718928   107 / 2760977 -- 81 / 718928 0 / 9837 107 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 9 / 94929 -- 12 / 138066 -- 9 / 94929 -- 12 / 138066 --
gastrointestinal tract 3 / 34979 -- 12 / 548222 -- 3 / 34979 -- 12 / 548222 --
heart 6 / 49793 -- 19 / 1231698 -- 6 / 49793 -- 19 / 1231698 --
kidney 26 / 121184   20 / 1415985 -- 26 / 121184 0 / 2215 20 / 1415985 --
limb   -- 26 / 595880 -- 0 / 16187 -- 26 / 595880 --
liver 2 / 104633 4 / 6685 2 / 527425 -- 2 / 104633 4 / 6685 2 / 527425 --
lung 13 / 26861 20 / 72516 71 / 943009 -- 13 / 26861 20 / 72516 71 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 18 / 344354 -- 1 / 14648 -- 18 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464 68 / 216846 24 / 960632 7 / 178606 5 / 85464 68 / 216846 24 / 960632 7 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 7 / 35780 -- -- -- 7 / 35780 -- -- --
ovary 4 / 43149 -- 7 / 354066 -- 4 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas 8 / 75220   21 / 1338446 -- 8 / 75220 0 / 34 21 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 7 / 37653 -- 14 / 292212 -- 7 / 37653 -- 14 / 292212 --
pooled tissue 11 / 99675 -- -- -- 11 / 99675 -- -- --
prostate     6 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 6 / 386047 --
retina 7 / 82470 -- 3 / 636203 -- 7 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 9 / 85891 3 / 31511 15 / 615945 4 / 57574 9 / 85891 3 / 31511 15 / 615945 4 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492   27 / 386635 -- 4 / 73492 0 / 17831 27 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 6 / 218318 -- 2 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   20 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 20 / 736319 --
thymus 15 / 100203 2 / 20273 10 / 346181 -- 15 / 100203 2 / 20273 10 / 346181 --
thyroid 5 / 8821 -- -- -- 5 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 29 / 262740 5 / 14058   -- 29 / 262740 5 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 8 / 206823 -- 1 / 6854 -- 8 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 34 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 34 / 1092595 --
white blood cells -- -- 7 / 398838 -- -- -- 7 / 398838 --
whole body -- -- 6 / 531904   -- -- 6 / 531904 0 / 212613