Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.38155Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 232 / 3259021 39 / 403641 1323 / 25718729 14 / 491920 232 / 3259021 39 / 403641 1323 / 25718729 14 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 3 / 64924 -- 2 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow   -- 2 / 103390 -- 0 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 14 / 261599 1 / 2128 631 / 7554651 -- 14 / 261599 1 / 2128 631 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 5 / 233710   5 / 56549 -- 5 / 233710 0 / 43127
cerebrum 45 / 228104 -- -- -- 45 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 46 / 718928   129 / 2760977 -- 46 / 718928 0 / 9837 129 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye   -- 6 / 138066 -- 0 / 94929 -- 6 / 138066 --
gastrointestinal tract 3 / 34979 -- 19 / 548222 -- 3 / 34979 -- 19 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 49 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 49 / 1231698 --
kidney 7 / 121184 2 / 2215 41 / 1415985 -- 7 / 121184 2 / 2215 41 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 15 / 595880 -- 1 / 16187 -- 15 / 595880 --
liver 3 / 104633   19 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 19 / 527425 --
lung   4 / 72516 31 / 943009 -- 0 / 26861 4 / 72516 31 / 943009 --
lymph node 4 / 14648 -- 23 / 344354 -- 4 / 14648 -- 23 / 344354 --
lymphoreticular   3 / 5421 -- -- 0 / 3137 3 / 5421 -- --
mammary gland 16 / 85464 9 / 216846 21 / 960632 9 / 178606 16 / 85464 9 / 216846 21 / 960632 9 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 4 / 137075 -- 3 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 9 / 43149 -- 9 / 354066 -- 9 / 43149 -- 9 / 354066 --
pancreas     67 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 67 / 1338446 --
pancreatic islet 5 / 30771 -- -- -- 5 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 12 / 145854 -- 0 / 17986 -- 12 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 11 / 292212 -- 2 / 37653 -- 11 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate 3 / 23701   12 / 386047 -- 3 / 23701 0 / 5 12 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 9 / 636203 -- 4 / 82470 -- 9 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434 1 / 958 -- -- 2 / 18434 1 / 958 -- --
skin 5 / 85891 2 / 31511 20 / 615945 1 / 57574 5 / 85891 2 / 31511 20 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen   4 / 17831 14 / 386635 -- 0 / 73492 4 / 17831 14 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 6 / 218318 -- 1 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 11 / 116987   28 / 736319 -- 11 / 116987 0 / 2634 28 / 736319 --
thymus 11 / 100203 13 / 20273 39 / 346181 -- 11 / 100203 13 / 20273 39 / 346181 --
thyroid 2 / 8821 -- -- -- 2 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 11 / 262740   1 / 25954 -- 11 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 26 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 26 / 1092595 --
white blood cells -- -- 21 / 398838 -- -- -- 21 / 398838 --
whole body -- -- 41 / 531904 4 / 212613 -- -- 41 / 531904 4 / 212613