Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.37368Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 88 / 3259021 51 / 403641 299 / 25718729 13 / 491920 88 / 3259021 51 / 403641 299 / 25718729 13 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 2 / 103390 -- 1 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 2 / 261599   40 / 7554651 -- 2 / 261599 0 / 2128 40 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 6 / 51804   -- -- 6 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 12 / 718928 3 / 9837 42 / 2760977 -- 12 / 718928 3 / 9837 42 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 3 / 138066 -- 3 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 6 / 548222 -- 1 / 34979 -- 6 / 548222 --
heart 5 / 49793 -- 19 / 1231698 -- 5 / 49793 -- 19 / 1231698 --
kidney 11 / 121184   8 / 1415985 -- 11 / 121184 0 / 2215 8 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver 9 / 104633   2 / 527425 -- 9 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung 1 / 26861 14 / 72516 9 / 943009 -- 1 / 26861 14 / 72516 9 / 943009 --
lymph node   -- 3 / 344354 -- 0 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 30 / 216846 25 / 960632 2 / 178606 3 / 85464 30 / 216846 25 / 960632 2 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 2 / 354066 -- 1 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas     21 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 21 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 7 / 636203 -- 3 / 82470 -- 7 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891   8 / 615945 2 / 57574 1 / 85891 0 / 31511 8 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 1 / 218318 -- 2 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis   1 / 2634 4 / 736319 -- 0 / 116987 1 / 2634 4 / 736319 --
thymus 5 / 100203 2 / 20273 2 / 346181 -- 5 / 100203 2 / 20273 2 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740     -- 8 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 1 / 206823 -- 1 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 78 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 78 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904 9 / 212613 -- -- 3 / 531904 9 / 212613