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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.35545Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 46 / 3259021 3 / 403641 350 / 25718729 1 / 491920 46 / 3259021 3 / 403641 350 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 2 / 261599   74 / 7554651 -- 2 / 261599 0 / 2128 74 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 2 / 233710   2 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 17 / 718928   68 / 2760977 -- 17 / 718928 0 / 9837 68 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 3 / 211918 -- -- -- 3 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 6 / 138066 -- 1 / 94929 -- 6 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 15 / 548222 -- 0 / 34979 -- 15 / 548222 --
heart   -- 19 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 19 / 1231698 --
kidney 2 / 121184   29 / 1415985 -- 2 / 121184 0 / 2215 29 / 1415985 --
limb   -- 9 / 595880 -- 0 / 16187 -- 9 / 595880 --
liver 7 / 104633   4 / 527425 -- 7 / 104633 0 / 6685 4 / 527425 --
lung   1 / 72516 9 / 943009 -- 0 / 26861 1 / 72516 9 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 2 / 216846 5 / 960632 1 / 178606 1 / 85464 2 / 216846 5 / 960632 1 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 7 / 354066 -- 0 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas     7 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 7 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland 2 / 3907 -- -- -- 2 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta   -- 10 / 292212 -- 0 / 37653 -- 10 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 5 / 636203 -- 3 / 82470 -- 5 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     5 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 5 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     8 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 8 / 386635 --
stem cell -- -- 9 / 234473 -- -- -- 9 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 2 / 218318 -- 1 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     31 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 31 / 736319 --
thymus     4 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 4 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 3 / 262740     -- 3 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 4 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 4 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 7 / 531904   -- -- 7 / 531904 0 / 212613