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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.3521Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 38 / 3259021   4404 / 25718729 56 / 491920 38 / 3259021 0 / 403641 4404 / 25718729 56 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   -- 6 / 103390 -- 0 / 100926 -- 6 / 103390 --
brain     2560 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 2560 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 38 / 233710 15 / 43127 0 / 56549 -- 38 / 233710 15 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue     259 / 2760977 -- 0 / 718928 0 / 9837 259 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 18 / 211918 -- -- -- 18 / 211918 --
eye   -- 13 / 138066 -- 0 / 94929 -- 13 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 45 / 548222 -- 0 / 34979 -- 45 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 121 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 121 / 1231698 --
kidney 20 / 121184   251 / 1415985 -- 20 / 121184 0 / 2215 251 / 1415985 --
limb   -- 39 / 595880 -- 0 / 16187 -- 39 / 595880 --
liver     54 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 54 / 527425 --
lung 4 / 26861   79 / 943009 -- 4 / 26861 0 / 72516 79 / 943009 --
lymph node   -- 28 / 344354 -- 0 / 14648 -- 28 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     128 / 960632 26 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 128 / 960632 26 / 178606
muscle   -- 9 / 137075 -- 0 / 24130 -- 9 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 22 / 354066 -- 0 / 43149 -- 22 / 354066 --
pancreas 6 / 75220   170 / 1338446 -- 6 / 75220 0 / 34 170 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 23 / 145854 -- 0 / 17986 -- 23 / 145854 --
placenta   -- 28 / 292212 -- 0 / 37653 -- 28 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate     55 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 55 / 386047 --
retina   -- 80 / 636203 -- 0 / 82470 -- 80 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     60 / 615945 3 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 60 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   30 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 30 / 386635 --
stem cell -- -- 12 / 234473 -- -- -- 12 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 20 / 218318 -- 3 / 21241 -- 20 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     50 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 50 / 736319 --
thymus     24 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 24 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue     1 / 25954 -- 0 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 5 / 206823 -- 0 / 6854 -- 5 / 206823 --
vascular   -- 91 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 91 / 1092595 --
white blood cells -- -- 21 / 398838 -- -- -- 21 / 398838 --
whole body -- -- 63 / 531904 12 / 212613 -- -- 63 / 531904 12 / 212613