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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.35088Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 100 / 3259021   72 / 25718729   100 / 3259021 0 / 403641 72 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 51 / 261599   55 / 7554651 -- 51 / 261599 0 / 2128 55 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 --     3 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 10 / 228104 -- -- -- 10 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 7 / 718928   4 / 2760977 -- 7 / 718928 0 / 9837 4 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 8 / 94929 --   -- 8 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 1 / 104633     -- 1 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung       -- 0 / 26861 0 / 72516 0 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464       4 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas       -- 0 / 75220 0 / 34 0 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 5 / 636203 -- 4 / 82470 -- 5 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin         0 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492     -- 1 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis       -- 0 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus     1 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740     -- 1 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 2 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 2 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613