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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.3406Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 358 / 3259021 41 / 403641 1061 / 25718729 18 / 491920 358 / 3259021 41 / 403641 1061 / 25718729 18 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 12 / 38915 -- 4 / 64924 -- 12 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 --   -- 2 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 37 / 261599   133 / 7554651 -- 37 / 261599 0 / 2128 133 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 6 / 56549 -- 23 / 233710   6 / 56549 -- 23 / 233710 0 / 43127
cerebrum 9 / 228104 -- -- -- 9 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 15 / 39315 -- -- -- 15 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 114 / 718928 2 / 9837 232 / 2760977 -- 114 / 718928 2 / 9837 232 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 5 / 211918 -- -- -- 5 / 211918 --
eye 8 / 94929 -- 18 / 138066 -- 8 / 94929 -- 18 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 46 / 548222 -- 2 / 34979 -- 46 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 51 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 51 / 1231698 --
kidney 12 / 121184   38 / 1415985 -- 12 / 121184 0 / 2215 38 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 36 / 595880 -- 1 / 16187 -- 36 / 595880 --
liver 6 / 104633   13 / 527425 -- 6 / 104633 0 / 6685 13 / 527425 --
lung 2 / 26861 12 / 72516 87 / 943009 -- 2 / 26861 12 / 72516 87 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 13 / 344354 -- 2 / 14648 -- 13 / 344354 --
lymphoreticular 1 / 3137   -- -- 1 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464 25 / 216846 26 / 960632 7 / 178606 5 / 85464 25 / 216846 26 / 960632 7 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 3 / 137075 -- 1 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 5 / 354066 -- 2 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   45 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 45 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland 2 / 3907 -- -- -- 2 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta   -- 11 / 292212 -- 0 / 37653 -- 11 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate     14 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 14 / 386047 --
retina 6 / 82470 -- 42 / 636203 -- 6 / 82470 -- 42 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 13 / 85891 1 / 31511 33 / 615945 3 / 57574 13 / 85891 1 / 31511 33 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 18 / 73492 1 / 17831 38 / 386635 -- 18 / 73492 1 / 17831 38 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   -- 10 / 218318 -- 0 / 21241 -- 10 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 10 / 116987   34 / 736319 -- 10 / 116987 0 / 2634 34 / 736319 --
thymus 25 / 100203   33 / 346181 -- 25 / 100203 0 / 20273 33 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 16 / 262740     -- 16 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 11 / 206823 -- 0 / 6854 -- 11 / 206823 --
vascular 4 / 12366 -- 30 / 1092595 -- 4 / 12366 -- 30 / 1092595 --
white blood cells -- -- 11 / 398838 -- -- -- 11 / 398838 --
whole body -- -- 12 / 531904 8 / 212613 -- -- 12 / 531904 8 / 212613