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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.33996Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 11 / 3259021 6 / 403641 801 / 25718729 16 / 491920 11 / 3259021 6 / 403641 801 / 25718729 16 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 5 / 64924 -- 0 / 38915 -- 5 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 -- 3 / 103390 -- 5 / 100926 -- 3 / 103390 --
brain     146 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 146 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 8 / 233710   0 / 56549 -- 8 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue     145 / 2760977 -- 0 / 718928 0 / 9837 145 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye   -- 3 / 138066 -- 0 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 17 / 548222 -- 0 / 34979 -- 17 / 548222 --
heart   -- 34 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 34 / 1231698 --
kidney     32 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 32 / 1415985 --
limb   -- 47 / 595880 -- 0 / 16187 -- 47 / 595880 --
liver     35 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 35 / 527425 --
lung   2 / 72516 30 / 943009 -- 0 / 26861 2 / 72516 30 / 943009 --
lymph node   -- 15 / 344354 -- 0 / 14648 -- 15 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   4 / 216846 22 / 960632 8 / 178606 0 / 85464 4 / 216846 22 / 960632 8 / 178606
muscle   -- 5 / 137075 -- 0 / 24130 -- 5 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 9 / 354066 -- 0 / 43149 -- 9 / 354066 --
pancreas     28 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 28 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 3 / 145854 -- 0 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     16 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 16 / 386047 --
retina   -- 6 / 636203 -- 0 / 82470 -- 6 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     17 / 615945 1 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 17 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492   4 / 386635 -- 3 / 73492 0 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- -- 11 / 234473 -- -- -- 11 / 234473 --
stomach   -- 11 / 218318 -- 0 / 21241 -- 11 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     23 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 23 / 736319 --
thymus 2 / 100203   24 / 346181 -- 2 / 100203 0 / 20273 24 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740     -- 1 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 39 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 39 / 1092595 --
white blood cells -- -- 44 / 398838 -- -- -- 44 / 398838 --
whole body -- -- 15 / 531904 7 / 212613 -- -- 15 / 531904 7 / 212613