Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.339224Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 125 / 3259021 18 / 403641 192 / 25718729 3 / 491920 125 / 3259021 18 / 403641 192 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 1 / 64924 -- 3 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 11 / 261599   63 / 7554651 -- 11 / 261599 0 / 2128 63 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 4 / 233710   4 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum 8 / 228104 -- -- -- 8 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 34 / 718928   21 / 2760977 -- 34 / 718928 0 / 9837 21 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 1 / 138066 -- 3 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 5 / 548222 -- 0 / 34979 -- 5 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 12 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 12 / 1231698 --
kidney     8 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 8 / 1415985 --
limb   -- 5 / 595880 -- 0 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver     1 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 1 / 26861 2 / 72516 9 / 943009 -- 1 / 26861 2 / 72516 9 / 943009 --
lymph node 4 / 14648 -- 4 / 344354 -- 4 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 11 / 85464 5 / 216846 8 / 960632   11 / 85464 5 / 216846 8 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 8 / 43149 -- 3 / 354066 -- 8 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas     8 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 8 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 3 / 37653 -- 2 / 292212 -- 3 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   3 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 7 / 636203 -- 3 / 82470 -- 7 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891   11 / 615945 1 / 57574 3 / 85891 0 / 31511 11 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   2 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 1 / 218318 -- 1 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   2 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 2 / 100203 8 / 20273 4 / 346181 -- 2 / 100203 8 / 20273 4 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740 2 / 14058   -- 8 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 4 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 4 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904 2 / 212613 -- -- 1 / 531904 2 / 212613