Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.335659Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 53 / 3259021 9 / 403641 168 / 25718729 6 / 491920 53 / 3259021 9 / 403641 168 / 25718729 6 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 -- 2 / 103390 -- 3 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 1 / 261599   22 / 7554651 -- 1 / 261599 0 / 2128 22 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 4 / 233710   0 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 15 / 718928   10 / 2760977 -- 15 / 718928 0 / 9837 10 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 2 / 548222 -- 1 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   -- 7 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 7 / 1231698 --
kidney     5 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 5 / 1415985 --
limb   -- 7 / 595880 -- 0 / 16187 -- 7 / 595880 --
liver   2 / 6685 1 / 527425 -- 0 / 104633 2 / 6685 1 / 527425 --
lung 1 / 26861 2 / 72516 8 / 943009 -- 1 / 26861 2 / 72516 8 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 5 / 344354 -- 1 / 14648 -- 5 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 5 / 216846 17 / 960632 4 / 178606 3 / 85464 5 / 216846 17 / 960632 4 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 3 / 354066 -- 0 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   7 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 7 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   3 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 5 / 82470 -- 5 / 636203 -- 5 / 82470 -- 5 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     8 / 615945 1 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 8 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 11 / 73492   4 / 386635 -- 11 / 73492 0 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   9 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 9 / 736319 --
thymus 2 / 100203   7 / 346181 -- 2 / 100203 0 / 20273 7 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 4 / 262740     -- 4 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 14 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 14 / 1092595 --
white blood cells -- -- 12 / 398838 -- -- -- 12 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904 1 / 212613 -- -- 1 / 531904 1 / 212613