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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.335249Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 355 / 3259021 50 / 403641 6815 / 25718729 67 / 491920 355 / 3259021 50 / 403641 6815 / 25718729 67 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 13 / 64924 -- 0 / 38915 -- 13 / 64924 --
bone marrow   -- 32 / 103390 -- 0 / 100926 -- 32 / 103390 --
brain 18 / 261599   2426 / 7554651 -- 18 / 261599 0 / 2128 2426 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 73 / 233710 1 / 43127 0 / 56549 -- 73 / 233710 1 / 43127
cerebrum 14 / 228104 -- -- -- 14 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 7 / 51804   -- -- 7 / 51804 0 / 689 -- --
ear 9 / 39315 -- -- -- 9 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 61 / 718928   731 / 2760977 -- 61 / 718928 0 / 9837 731 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 67 / 211918 -- -- -- 67 / 211918 --
eye 5 / 94929 -- 23 / 138066 -- 5 / 94929 -- 23 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 106 / 548222 -- 2 / 34979 -- 106 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 289 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 289 / 1231698 --
kidney 19 / 121184   257 / 1415985 -- 19 / 121184 0 / 2215 257 / 1415985 --
limb   -- 217 / 595880 -- 0 / 16187 -- 217 / 595880 --
liver 19 / 104633   100 / 527425 -- 19 / 104633 0 / 6685 100 / 527425 --
lung 3 / 26861 25 / 72516 233 / 943009 -- 3 / 26861 25 / 72516 233 / 943009 --
lymph node   -- 50 / 344354 -- 0 / 14648 -- 50 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   25 / 216846 162 / 960632 22 / 178606 0 / 85464 25 / 216846 162 / 960632 22 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 35 / 137075 -- 1 / 24130 -- 35 / 137075 --
nervous 5 / 35780 -- -- -- 5 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 159 / 354066 -- 1 / 43149 -- 159 / 354066 --
pancreas 77 / 75220   465 / 1338446 -- 77 / 75220 0 / 34 465 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 11 / 145854 -- 2 / 17986 -- 11 / 145854 --
placenta 16 / 37653 -- 182 / 292212 -- 16 / 37653 -- 182 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate 20 / 23701   168 / 386047 -- 20 / 23701 0 / 5 168 / 386047 --
retina 8 / 82470 -- 46 / 636203 -- 8 / 82470 -- 46 / 636203 --
salivary gland 4 / 18434   -- -- 4 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   123 / 615945 13 / 57574 2 / 85891 0 / 31511 123 / 615945 13 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   81 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 81 / 386635 --
stem cell -- -- 39 / 234473 -- -- -- 39 / 234473 --
stomach 10 / 21241 -- 90 / 218318 -- 10 / 21241 -- 90 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 9 / 116987   101 / 736319 -- 9 / 116987 0 / 2634 101 / 736319 --
thymus 4 / 100203   55 / 346181 -- 4 / 100203 0 / 20273 55 / 346181 --
thyroid 12 / 8821 -- -- -- 12 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 16 / 262740   14 / 25954 -- 16 / 262740 0 / 14058 14 / 25954 --
uterus   -- 54 / 206823 -- 0 / 6854 -- 54 / 206823 --
vascular   -- 200 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 200 / 1092595 --
white blood cells -- -- 107 / 398838 -- -- -- 107 / 398838 --
whole body -- -- 106 / 531904 31 / 212613 -- -- 106 / 531904 31 / 212613