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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.335247Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 45 / 3259021   226 / 25718729 1 / 491920 45 / 3259021 0 / 403641 226 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     69 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 69 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 5 / 51804   -- -- 5 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 3 / 718928   17 / 2760977 -- 3 / 718928 0 / 9837 17 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 31 / 34979 -- 3 / 548222 -- 31 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart   -- 5 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 5 / 1231698 --
kidney 3 / 121184   70 / 1415985 -- 3 / 121184 0 / 2215 70 / 1415985 --
limb   -- 4 / 595880 -- 0 / 16187 -- 4 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung     5 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 5 / 943009 --
lymph node   -- 1 / 344354 -- 0 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     2 / 960632 1 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 2 / 960632 1 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     7 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 7 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina   -- 3 / 636203 -- 0 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     4 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     3 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 3 / 736319 --
thymus 3 / 100203   2 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 2 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue       -- 0 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 16 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 16 / 1092595 --
white blood cells -- -- 3 / 398838 -- -- -- 3 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904   -- -- 1 / 531904 0 / 212613