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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.334444Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 313 / 3259021   94 / 25718729 1 / 491920 313 / 3259021 0 / 403641 94 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 9 / 64924 -- 0 / 38915 -- 9 / 64924 --
bone marrow   -- 2 / 103390 -- 0 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 117 / 261599   11 / 7554651 -- 117 / 261599 0 / 2128 11 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 --     2 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 29 / 718928   2 / 2760977 -- 29 / 718928 0 / 9837 2 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 1 / 138066 -- 2 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart 6 / 49793 -- 13 / 1231698 -- 6 / 49793 -- 13 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb   -- 5 / 595880 -- 0 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver 19 / 104633   7 / 527425 -- 19 / 104633 0 / 6685 7 / 527425 --
lung 1 / 26861   1 / 943009 -- 1 / 26861 0 / 72516 1 / 943009 --
lymph node 4 / 14648 --   -- 4 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     2 / 960632   0 / 85464 0 / 216846 2 / 960632 0 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 20 / 137075 -- 1 / 24130 -- 20 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     2 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 2 / 292212 -- 0 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 12 / 99675 -- -- -- 12 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 1 / 636203 -- 2 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   7 / 615945   2 / 85891 0 / 31511 7 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     2 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 113 / 262740     -- 113 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 1 / 212613 -- -- 2 / 531904 1 / 212613