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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.333893Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 221 / 3259021 40 / 403641 239 / 25718729 3 / 491920 221 / 3259021 40 / 403641 239 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 9 / 38915 --   -- 9 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 16 / 100926 --   -- 16 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 5 / 261599   77 / 7554651 -- 5 / 261599 0 / 2128 77 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 1 / 233710   2 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 6 / 228104 -- -- -- 6 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 9 / 51804   -- -- 9 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 59 / 718928   35 / 2760977 -- 59 / 718928 0 / 9837 35 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 1 / 138066 -- 3 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 4 / 548222 -- 0 / 34979 -- 4 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 12 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 12 / 1231698 --
kidney 7 / 121184 1 / 2215 8 / 1415985 -- 7 / 121184 1 / 2215 8 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 5 / 595880 -- 1 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver 6 / 104633   9 / 527425 -- 6 / 104633 0 / 6685 9 / 527425 --
lung 3 / 26861 4 / 72516 12 / 943009 -- 3 / 26861 4 / 72516 12 / 943009 --
lymph node   -- 6 / 344354 -- 0 / 14648 -- 6 / 344354 --
lymphoreticular 1 / 3137   -- -- 1 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 15 / 216846 7 / 960632 2 / 178606 7 / 85464 15 / 216846 7 / 960632 2 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 5 / 35780 -- -- -- 5 / 35780 -- -- --
ovary   -- 3 / 354066 -- 0 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   12 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 12 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 3 / 292212 -- 1 / 37653 -- 3 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   3 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 3 / 82470 --   -- 3 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 9 / 85891 14 / 31511 7 / 615945   9 / 85891 14 / 31511 7 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 9 / 73492 1 / 17831 2 / 386635 -- 9 / 73492 1 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   -- 4 / 218318 -- 0 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 7 / 116987   5 / 736319 -- 7 / 116987 0 / 2634 5 / 736319 --
thymus 4 / 100203 1 / 20273 6 / 346181 -- 4 / 100203 1 / 20273 6 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 22 / 262740 4 / 14058   -- 22 / 262740 4 / 14058 0 / 25954 --
uterus 3 / 6854 -- 3 / 206823 -- 3 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- -- 4 / 398838 -- -- -- 4 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904 1 / 212613 -- -- 3 / 531904 1 / 212613