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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.333233Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 215 / 3259021 27 / 403641 2676 / 25718729 60 / 491920 215 / 3259021 27 / 403641 2676 / 25718729 60 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 4 / 38915 -- 3 / 64924 -- 4 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 -- 30 / 103390 -- 5 / 100926 -- 30 / 103390 --
brain 11 / 261599   901 / 7554651 -- 11 / 261599 0 / 2128 901 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 41 / 233710 10 / 43127 3 / 56549 -- 41 / 233710 10 / 43127
cerebrum 51 / 228104 -- -- -- 51 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 33 / 718928   225 / 2760977 -- 33 / 718928 0 / 9837 225 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 5 / 211918 -- -- -- 5 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 5 / 138066 -- 4 / 94929 -- 5 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 60 / 548222 -- 0 / 34979 -- 60 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 122 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 122 / 1231698 --
kidney 12 / 121184   167 / 1415985 -- 12 / 121184 0 / 2215 167 / 1415985 --
limb   -- 41 / 595880 -- 0 / 16187 -- 41 / 595880 --
liver 4 / 104633   43 / 527425 -- 4 / 104633 0 / 6685 43 / 527425 --
lung 3 / 26861 7 / 72516 97 / 943009 -- 3 / 26861 7 / 72516 97 / 943009 --
lymph node   -- 37 / 344354 -- 0 / 14648 -- 37 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 9 / 85464 17 / 216846 107 / 960632 28 / 178606 9 / 85464 17 / 216846 107 / 960632 28 / 178606
muscle   -- 20 / 137075 -- 0 / 24130 -- 20 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 23 / 354066 -- 3 / 43149 -- 23 / 354066 --
pancreas 6 / 75220   111 / 1338446 -- 6 / 75220 0 / 34 111 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 2 / 3907 -- -- -- 2 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 24 / 145854 -- 0 / 17986 -- 24 / 145854 --
placenta 3 / 37653 -- 22 / 292212 -- 3 / 37653 -- 22 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate     44 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 44 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 70 / 636203 -- 4 / 82470 -- 70 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891 3 / 31511 70 / 615945 5 / 57574 1 / 85891 3 / 31511 70 / 615945 5 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   36 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 36 / 386635 --
stem cell -- -- 20 / 234473 -- -- -- 20 / 234473 --
stomach 7 / 21241 -- 20 / 218318 -- 7 / 21241 -- 20 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     31 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 31 / 736319 --
thymus 5 / 100203   21 / 346181 -- 5 / 100203 0 / 20273 21 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 27 / 262740   3 / 25954 -- 27 / 262740 0 / 14058 3 / 25954 --
uterus   -- 16 / 206823 -- 0 / 6854 -- 16 / 206823 --
vascular   -- 196 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 196 / 1092595 --
white blood cells -- -- 27 / 398838 -- -- -- 27 / 398838 --
whole body -- -- 38 / 531904 17 / 212613 -- -- 38 / 531904 17 / 212613