Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.332793Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 38 / 3259021   266 / 25718729   38 / 3259021 0 / 403641 266 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     13 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 13 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 10 / 718928   14 / 2760977 -- 10 / 718928 0 / 9837 14 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 1 / 138066 -- 1 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 3 / 548222 -- 0 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 148 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 148 / 1231698 --
kidney     2 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 2 / 1415985 --
limb   -- 9 / 595880 -- 0 / 16187 -- 9 / 595880 --
liver     9 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 9 / 527425 --
lung     5 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 5 / 943009 --
lymph node   -- 1 / 344354 -- 0 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     1 / 960632   0 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle 12 / 24130 -- 8 / 137075 -- 12 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 --   -- 1 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   10 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 10 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 3 / 292212 -- 0 / 37653 -- 3 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 2 / 636203 -- 2 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     6 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 6 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     15 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 15 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 7 / 218318 -- 0 / 21241 -- 7 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     1 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 2 / 100203     -- 2 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740     -- 1 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 --   -- 1 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904   -- -- 4 / 531904 0 / 212613