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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.33120Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 54 / 3259021 7 / 403641 137 / 25718729   54 / 3259021 7 / 403641 137 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 4 / 100926 --   -- 4 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 12 / 261599   60 / 7554651 -- 12 / 261599 0 / 2128 60 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 --     2 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 1 / 718928   2 / 2760977 -- 1 / 718928 0 / 9837 2 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 3 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 3 / 1231698 --
kidney 2 / 121184   11 / 1415985 -- 2 / 121184 0 / 2215 11 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver   2 / 6685 4 / 527425 -- 0 / 104633 2 / 6685 4 / 527425 --
lung 1 / 26861   2 / 943009 -- 1 / 26861 0 / 72516 2 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 14 / 85464   21 / 960632   14 / 85464 0 / 216846 21 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 5 / 354066 -- 0 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   5 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 5 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 3 / 145854 -- 2 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina   -- 2 / 636203 -- 0 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     4 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492 5 / 17831   -- 4 / 73492 5 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     5 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 5 / 736319 --
thymus 1 / 100203     -- 1 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740     -- 1 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 4 / 206823 -- 0 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular   -- 1 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904   -- -- 1 / 531904 0 / 212613