Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.330055Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 309 / 3259021 52 / 403641 572 / 25718729 3 / 491920 309 / 3259021 52 / 403641 572 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 8 / 100926 -- 1 / 103390 -- 8 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 2 / 261599   145 / 7554651 -- 2 / 261599 0 / 2128 145 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 14 / 228104 -- -- -- 14 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 8 / 39315 -- -- -- 8 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 91 / 718928 2 / 9837 57 / 2760977 -- 91 / 718928 2 / 9837 57 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 6 / 94929 -- 3 / 138066 -- 6 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 5 / 34979 -- 15 / 548222 -- 5 / 34979 -- 15 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 19 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 19 / 1231698 --
kidney 28 / 121184   118 / 1415985 -- 28 / 121184 0 / 2215 118 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 10 / 595880 -- 2 / 16187 -- 10 / 595880 --
liver 18 / 104633 2 / 6685 30 / 527425 -- 18 / 104633 2 / 6685 30 / 527425 --
lung 3 / 26861 4 / 72516 12 / 943009 -- 3 / 26861 4 / 72516 12 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 2 / 344354 -- 1 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 21 / 85464 17 / 216846 4 / 960632   21 / 85464 17 / 216846 4 / 960632 0 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 1 / 137075 -- 2 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 7 / 43149 -- 7 / 354066 -- 7 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   32 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 32 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 12 / 292212 -- 2 / 37653 -- 12 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 1 / 636203 -- 1 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891 3 / 31511 9 / 615945   6 / 85891 3 / 31511 9 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492   6 / 386635 -- 8 / 73492 0 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- -- 5 / 234473 -- -- -- 5 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 2 / 218318 -- 2 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis 10 / 116987 1 / 2634 6 / 736319 -- 10 / 116987 1 / 2634 6 / 736319 --
thymus 9 / 100203 15 / 20273 4 / 346181 -- 9 / 100203 15 / 20273 4 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 31 / 262740 7 / 14058   -- 31 / 262740 7 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 41 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 41 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 22 / 531904 3 / 212613 -- -- 22 / 531904 3 / 212613