Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.329353Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 533 / 3259021 121 / 403641 1280 / 25718729 20 / 491920 533 / 3259021 121 / 403641 1280 / 25718729 20 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 16 / 38915 -- 1 / 64924 -- 16 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 23 / 100926 -- 3 / 103390 -- 23 / 100926 -- 3 / 103390 --
brain 4 / 261599 3 / 2128 118 / 7554651 -- 4 / 261599 3 / 2128 118 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 6 / 233710 1 / 43127 1 / 56549 -- 6 / 233710 1 / 43127
cerebrum 27 / 228104 -- -- -- 27 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 6 / 39315 -- -- -- 6 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 202 / 718928 4 / 9837 306 / 2760977 -- 202 / 718928 4 / 9837 306 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 6 / 211918 -- -- -- 6 / 211918 --
eye 12 / 94929 -- 15 / 138066 -- 12 / 94929 -- 15 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 28 / 548222 -- 0 / 34979 -- 28 / 548222 --
heart 7 / 49793 -- 82 / 1231698 -- 7 / 49793 -- 82 / 1231698 --
kidney 16 / 121184 2 / 2215 54 / 1415985 -- 16 / 121184 2 / 2215 54 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 33 / 595880 -- 1 / 16187 -- 33 / 595880 --
liver 16 / 104633 2 / 6685 28 / 527425 -- 16 / 104633 2 / 6685 28 / 527425 --
lung 4 / 26861 4 / 72516 78 / 943009 -- 4 / 26861 4 / 72516 78 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 20 / 344354 -- 2 / 14648 -- 20 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 26 / 85464 47 / 216846 59 / 960632 4 / 178606 26 / 85464 47 / 216846 59 / 960632 4 / 178606
muscle 10 / 24130 -- 4 / 137075 -- 10 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 21 / 354066 -- 3 / 43149 -- 21 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   46 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 46 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 9 / 145854 -- 2 / 17986 -- 9 / 145854 --
placenta 9 / 37653 -- 17 / 292212 -- 9 / 37653 -- 17 / 292212 --
pooled tissue 12 / 99675 -- -- -- 12 / 99675 -- -- --
prostate 3 / 23701   18 / 386047 -- 3 / 23701 0 / 5 18 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 21 / 636203 -- 3 / 82470 -- 21 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434 2 / 958 -- -- 1 / 18434 2 / 958 -- --
skin 15 / 85891 17 / 31511 53 / 615945 1 / 57574 15 / 85891 17 / 31511 53 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492 19 / 17831 24 / 386635 -- 4 / 73492 19 / 17831 24 / 386635 --
stem cell -- -- 33 / 234473 -- -- -- 33 / 234473 --
stomach   -- 13 / 218318 -- 0 / 21241 -- 13 / 218318 --
synovium 4 / 16875 -- -- -- 4 / 16875 -- -- --
testis 18 / 116987   58 / 736319 -- 18 / 116987 0 / 2634 58 / 736319 --
thymus 20 / 100203 10 / 20273 17 / 346181 -- 20 / 100203 10 / 20273 17 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 53 / 262740 10 / 14058 2 / 25954 -- 53 / 262740 10 / 14058 2 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 10 / 206823 -- 1 / 6854 -- 10 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 68 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 68 / 1092595 --
white blood cells -- -- 5 / 398838 -- -- -- 5 / 398838 --
whole body -- -- 24 / 531904 14 / 212613 -- -- 24 / 531904 14 / 212613