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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.3272Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 73 / 3259021 3 / 403641 1034 / 25718729 1 / 491920 73 / 3259021 3 / 403641 1034 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 2 / 64924 -- 0 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow   -- 4 / 103390 -- 0 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain 11 / 261599   820 / 7554651 -- 11 / 261599 0 / 2128 820 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 --   1 / 43127 4 / 56549 -- 0 / 233710 1 / 43127
cerebrum 14 / 228104 -- -- -- 14 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 4 / 718928   6 / 2760977 -- 4 / 718928 0 / 9837 6 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 2 / 94929 --   -- 2 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 3 / 548222 -- 1 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart 5 / 49793 -- 19 / 1231698 -- 5 / 49793 -- 19 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb   -- 4 / 595880 -- 0 / 16187 -- 4 / 595880 --
liver 2 / 104633   5 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 5 / 527425 --
lung     12 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 12 / 943009 --
lymph node   -- 11 / 344354 -- 0 / 14648 -- 11 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 3 / 216846 15 / 960632   1 / 85464 3 / 216846 15 / 960632 0 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 13 / 137075 -- 1 / 24130 -- 13 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 3 / 354066 -- 0 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   12 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 12 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 7 / 145854 -- 0 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 19 / 292212 -- 2 / 37653 -- 19 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   19 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 19 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     6 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 6 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   4 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 2 / 21241 --   -- 2 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   1 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 3 / 100203   29 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 29 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 3 / 262740     -- 3 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 4 / 206823 -- 0 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular   -- 7 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 7 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 9 / 531904   -- -- 9 / 531904 0 / 212613