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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.32700Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 186 / 3259021 14 / 403641 141 / 25718729 1 / 491920 186 / 3259021 14 / 403641 141 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 7 / 100926 -- 2 / 103390 -- 7 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 15 / 261599   51 / 7554651 -- 15 / 261599 0 / 2128 51 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 1 / 233710   4 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 18 / 228104 -- -- -- 18 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 33 / 718928   10 / 2760977 -- 33 / 718928 0 / 9837 10 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 1 / 138066 -- 1 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract 6 / 34979 -- 2 / 548222 -- 6 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   -- 5 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 5 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   8 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 8 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver 21 / 104633 3 / 6685 20 / 527425 -- 21 / 104633 3 / 6685 20 / 527425 --
lung 1 / 26861 2 / 72516 5 / 943009 -- 1 / 26861 2 / 72516 5 / 943009 --
lymph node   -- 3 / 344354 -- 0 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 12 / 85464 5 / 216846 3 / 960632   12 / 85464 5 / 216846 3 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas 3 / 75220     -- 3 / 75220 0 / 34 0 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 2 / 145854 -- 2 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   1 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 2 / 636203 -- 2 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891 1 / 31511 5 / 615945   3 / 85891 1 / 31511 5 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 5 / 73492 2 / 17831 1 / 386635 -- 5 / 73492 2 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 1 / 218318 -- 2 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987 1 / 2634 3 / 736319 -- 1 / 116987 1 / 2634 3 / 736319 --
thymus 9 / 100203   3 / 346181 -- 9 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 17 / 262740   1 / 25954 -- 17 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 1 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 1 / 212613 -- -- 4 / 531904 1 / 212613