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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.3233Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 343 / 3259021 68 / 403641 858 / 25718729 18 / 491920 343 / 3259021 68 / 403641 858 / 25718729 18 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 25 / 38915 -- 1 / 64924 -- 25 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 119 / 100926 -- 39 / 103390 -- 119 / 100926 -- 39 / 103390 --
brain     22 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 22 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 7 / 233710   0 / 56549 -- 7 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 9 / 51804   -- -- 9 / 51804 0 / 689 -- --
ear 19 / 39315 -- -- -- 19 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 10 / 718928   106 / 2760977 -- 10 / 718928 0 / 9837 106 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 2 / 94929 --   -- 2 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 11 / 34979 -- 3 / 548222 -- 11 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart   -- 1 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney 2 / 121184 1 / 2215 13 / 1415985 -- 2 / 121184 1 / 2215 13 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver 2 / 104633 2 / 6685 6 / 527425 -- 2 / 104633 2 / 6685 6 / 527425 --
lung 2 / 26861 20 / 72516 23 / 943009 -- 2 / 26861 20 / 72516 23 / 943009 --
lymph node 3 / 14648 -- 48 / 344354 -- 3 / 14648 -- 48 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 45 / 216846 129 / 960632 16 / 178606 2 / 85464 45 / 216846 129 / 960632 16 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 4 / 354066 -- 0 / 43149 -- 4 / 354066 --
pancreas     16 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 16 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 3 / 145854 -- 0 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta 3 / 37653 -- 21 / 292212 -- 3 / 37653 -- 21 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate     60 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 60 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 2 / 636203 -- 3 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   13 / 615945 2 / 57574 2 / 85891 0 / 31511 13 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 82 / 73492   22 / 386635 -- 82 / 73492 0 / 17831 22 / 386635 --
stem cell -- -- 6 / 234473 -- -- -- 6 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 2 / 218318 -- 1 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis     7 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 7 / 736319 --
thymus 14 / 100203   21 / 346181 -- 14 / 100203 0 / 20273 21 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 21 / 262740     -- 21 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 3 / 206823 -- 2 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular 3 / 12366 -- 217 / 1092595 -- 3 / 12366 -- 217 / 1092595 --
white blood cells -- -- 54 / 398838 -- -- -- 54 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904   -- -- 4 / 531904 0 / 212613