Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.319947Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 93 / 3259021 2 / 403641 359 / 25718729 7 / 491920 93 / 3259021 2 / 403641 359 / 25718729 7 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 3 / 64924 -- 0 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 7 / 261599   118 / 7554651 -- 7 / 261599 0 / 2128 118 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 2 / 233710 3 / 43127 5 / 56549 -- 2 / 233710 3 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 12 / 39315 -- -- -- 12 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 38 / 718928   61 / 2760977 -- 38 / 718928 0 / 9837 61 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye   -- 2 / 138066 -- 0 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 10 / 548222 -- 0 / 34979 -- 10 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 13 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 13 / 1231698 --
kidney     15 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 15 / 1415985 --
limb   -- 18 / 595880 -- 0 / 16187 -- 18 / 595880 --
liver 2 / 104633   3 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung     15 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 15 / 943009 --
lymph node   -- 5 / 344354 -- 0 / 14648 -- 5 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 2 / 216846 8 / 960632   1 / 85464 2 / 216846 8 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary   -- 4 / 354066 -- 0 / 43149 -- 4 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   6 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 6 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate     4 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina   -- 7 / 636203 -- 0 / 82470 -- 7 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     4 / 615945 1 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     5 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 5 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 2 / 218318 -- 1 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis     13 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 13 / 736319 --
thymus 2 / 100203   3 / 346181 -- 2 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740     -- 8 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 17 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 17 / 1092595 --
white blood cells -- -- 8 / 398838 -- -- -- 8 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904 3 / 212613 -- -- 3 / 531904 3 / 212613