Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.319530Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 119 / 3259021 3 / 403641 752 / 25718729 54 / 491920 119 / 3259021 3 / 403641 752 / 25718729 54 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 4 / 64924 -- 0 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 2 / 103390 -- 1 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 4 / 261599   188 / 7554651 -- 4 / 261599 0 / 2128 188 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 22 / 233710 2 / 43127 0 / 56549 -- 22 / 233710 2 / 43127
cerebrum 11 / 228104 -- -- -- 11 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 5 / 51804   -- -- 5 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 34 / 718928 2 / 9837 50 / 2760977 -- 34 / 718928 2 / 9837 50 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 2 / 94929 --   -- 2 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 8 / 548222 -- 0 / 34979 -- 8 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 27 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 27 / 1231698 --
kidney 3 / 121184   33 / 1415985 -- 3 / 121184 0 / 2215 33 / 1415985 --
limb   -- 8 / 595880 -- 0 / 16187 -- 8 / 595880 --
liver 3 / 104633   12 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 12 / 527425 --
lung 4 / 26861   33 / 943009 -- 4 / 26861 0 / 72516 33 / 943009 --
lymph node   -- 14 / 344354 -- 0 / 14648 -- 14 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464   49 / 960632 42 / 178606 5 / 85464 0 / 216846 49 / 960632 42 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 4 / 137075 -- 3 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 18 / 354066 -- 1 / 43149 -- 18 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   66 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 66 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 5 / 37653 -- 3 / 292212 -- 5 / 37653 -- 3 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     28 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 28 / 386047 --
retina   -- 21 / 636203 -- 0 / 82470 -- 21 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891   26 / 615945 1 / 57574 1 / 85891 0 / 31511 26 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   20 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 20 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 4 / 218318 -- 1 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 6 / 116987   37 / 736319 -- 6 / 116987 0 / 2634 37 / 736319 --
thymus 10 / 100203   12 / 346181 -- 10 / 100203 0 / 20273 12 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 5 / 262740     -- 5 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 8 / 206823 -- 1 / 6854 -- 8 / 206823 --
vascular   -- 17 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 17 / 1092595 --
white blood cells -- -- 7 / 398838 -- -- -- 7 / 398838 --
whole body -- -- 26 / 531904 9 / 212613 -- -- 26 / 531904 9 / 212613