Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.3193Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 191 / 3259021 8 / 403641 987 / 25718729 13 / 491920 191 / 3259021 8 / 403641 987 / 25718729 13 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 2 / 64924 -- 2 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 --   -- 1 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 36 / 261599 1 / 2128 485 / 7554651 -- 36 / 261599 1 / 2128 485 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 47 / 233710 7 / 43127 5 / 56549 -- 47 / 233710 7 / 43127
cerebrum 41 / 228104 -- -- -- 41 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 41 / 718928   73 / 2760977 -- 41 / 718928 0 / 9837 73 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 1 / 138066 -- 7 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 7 / 548222 -- 0 / 34979 -- 7 / 548222 --
heart 8 / 49793 -- 42 / 1231698 -- 8 / 49793 -- 42 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   43 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 43 / 1415985 --
limb   -- 26 / 595880 -- 0 / 16187 -- 26 / 595880 --
liver     2 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung   2 / 72516 22 / 943009 -- 0 / 26861 2 / 72516 22 / 943009 --
lymph node   -- 3 / 344354 -- 0 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 3 / 216846 18 / 960632 3 / 178606 3 / 85464 3 / 216846 18 / 960632 3 / 178606
muscle 6 / 24130 -- 22 / 137075 -- 6 / 24130 -- 22 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary   -- 13 / 354066 -- 0 / 43149 -- 13 / 354066 --
pancreas     21 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 21 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 1 / 145854 -- 2 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina 6 / 82470 -- 68 / 636203 -- 6 / 82470 -- 68 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891 2 / 31511 12 / 615945   6 / 85891 2 / 31511 12 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   9 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 9 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 8 / 218318 -- 1 / 21241 -- 8 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   19 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 19 / 736319 --
thymus     4 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 4 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 5 / 262740     -- 5 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 7 / 206823 -- 0 / 6854 -- 7 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 25 / 531904 3 / 212613 -- -- 25 / 531904 3 / 212613