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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.310822Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 83 / 3259021   346 / 25718729 4 / 491920 83 / 3259021 0 / 403641 346 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 28 / 261599   278 / 7554651 -- 28 / 261599 0 / 2128 278 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 10 / 233710 3 / 43127 3 / 56549 -- 10 / 233710 3 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 16 / 718928   7 / 2760977 -- 16 / 718928 0 / 9837 7 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 2 / 94929 --   -- 2 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 3 / 548222 -- 0 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 11 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 11 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb   -- 3 / 595880 -- 0 / 16187 -- 3 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung       -- 0 / 26861 0 / 72516 0 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464   1 / 960632   2 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     2 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 3 / 9981 -- -- -- 3 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina 9 / 82470 -- 14 / 636203 -- 9 / 82470 -- 14 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     3 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 3 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     1 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     1 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 9 / 262740     -- 9 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 5 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --   1 / 212613 -- -- 0 / 531904 1 / 212613