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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.302496Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 61 / 3259021 3 / 403641 245 / 25718729   61 / 3259021 3 / 403641 245 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 10 / 261599   57 / 7554651 -- 10 / 261599 0 / 2128 57 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 --     4 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 5 / 228104 -- -- -- 5 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 5 / 718928   32 / 2760977 -- 5 / 718928 0 / 9837 32 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 1 / 138066 -- 4 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 5 / 548222 -- 0 / 34979 -- 5 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 14 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 14 / 1231698 --
kidney     14 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 14 / 1415985 --
limb   -- 5 / 595880 -- 0 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver     4 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 4 / 527425 --
lung 1 / 26861 3 / 72516 20 / 943009 -- 1 / 26861 3 / 72516 20 / 943009 --
lymph node   -- 4 / 344354 -- 0 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     5 / 960632   0 / 85464 0 / 216846 5 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 7 / 354066 -- 1 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas     13 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 13 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 2 / 292212 -- 0 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 4 / 636203 -- 3 / 82470 -- 4 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   1 / 615945   2 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     6 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 6 / 218318 -- 3 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   13 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 13 / 736319 --
thymus     7 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 7 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 9 / 262740     -- 9 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 7 / 206823 -- 0 / 6854 -- 7 / 206823 --
vascular   -- 6 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 6 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904   -- -- 4 / 531904 0 / 212613