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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.29978Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 554 / 3259021 37 / 403641 2506 / 25718729 50 / 491920 554 / 3259021 37 / 403641 2506 / 25718729 50 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 8 / 38915 -- 6 / 64924 -- 8 / 38915 -- 6 / 64924 --
bone marrow 14 / 100926 -- 4 / 103390 -- 14 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain 94 / 261599   699 / 7554651 -- 94 / 261599 0 / 2128 699 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 35 / 233710 7 / 43127 4 / 56549 -- 35 / 233710 7 / 43127
cerebrum 239 / 228104 -- -- -- 239 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 53 / 718928 3 / 9837 275 / 2760977 -- 53 / 718928 3 / 9837 275 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 31 / 211918 -- -- -- 31 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 22 / 138066 -- 4 / 94929 -- 22 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 46 / 548222 -- 0 / 34979 -- 46 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 103 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 103 / 1231698 --
kidney 6 / 121184   113 / 1415985 -- 6 / 121184 0 / 2215 113 / 1415985 --
limb 9 / 16187 -- 51 / 595880 -- 9 / 16187 -- 51 / 595880 --
liver 6 / 104633   32 / 527425 -- 6 / 104633 0 / 6685 32 / 527425 --
lung 6 / 26861 8 / 72516 148 / 943009 -- 6 / 26861 8 / 72516 148 / 943009 --
lymph node   -- 47 / 344354 -- 0 / 14648 -- 47 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 16 / 216846 73 / 960632 34 / 178606 3 / 85464 16 / 216846 73 / 960632 34 / 178606
muscle   -- 15 / 137075 -- 0 / 24130 -- 15 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 24 / 354066 -- 1 / 43149 -- 24 / 354066 --
pancreas     119 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 119 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 4 / 9981 -- -- -- 4 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 15 / 145854 -- 1 / 17986 -- 15 / 145854 --
placenta   -- 25 / 292212 -- 0 / 37653 -- 25 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate     37 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 37 / 386047 --
retina 5 / 82470 -- 97 / 636203 -- 5 / 82470 -- 97 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891 4 / 31511 57 / 615945 1 / 57574 2 / 85891 4 / 31511 57 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   65 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 65 / 386635 --
stem cell -- -- 16 / 234473 -- -- -- 16 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 18 / 218318 -- 3 / 21241 -- 18 / 218318 --
synovium 6 / 16875 -- -- -- 6 / 16875 -- -- --
testis 15 / 116987   99 / 736319 -- 15 / 116987 0 / 2634 99 / 736319 --
thymus 5 / 100203 5 / 20273 32 / 346181 -- 5 / 100203 5 / 20273 32 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 42 / 262740   1 / 25954 -- 42 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 12 / 206823 -- 2 / 6854 -- 12 / 206823 --
vascular   -- 141 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 141 / 1092595 --
white blood cells -- -- 22 / 398838 -- -- -- 22 / 398838 --
whole body -- -- 26 / 531904 8 / 212613 -- -- 26 / 531904 8 / 212613