Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.298798Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 218 / 3259021 28 / 403641 243 / 25718729 4 / 491920 218 / 3259021 28 / 403641 243 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 5 / 38915 --   -- 5 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 30 / 261599   150 / 7554651 -- 30 / 261599 0 / 2128 150 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 --   1 / 43127 2 / 56549 -- 0 / 233710 1 / 43127
cerebrum 61 / 228104 -- -- -- 61 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 47 / 718928   16 / 2760977 -- 47 / 718928 0 / 9837 16 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 1 / 94929 --   -- 1 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 6 / 548222 -- 0 / 34979 -- 6 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 1 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney     4 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 4 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver     1 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 1 / 26861   1 / 943009 -- 1 / 26861 0 / 72516 1 / 943009 --
lymph node   -- 5 / 344354 -- 0 / 14648 -- 5 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 7 / 216846 3 / 960632 3 / 178606 4 / 85464 7 / 216846 3 / 960632 3 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas 21 / 75220   4 / 1338446 -- 21 / 75220 0 / 34 4 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland 2 / 3907 -- -- -- 2 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 2 / 145854 -- 1 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 1 / 292212 -- 2 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 11 / 99675 -- -- -- 11 / 99675 -- -- --
prostate     5 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 5 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 13 / 636203 -- 3 / 82470 -- 13 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin   4 / 31511 6 / 615945   0 / 85891 4 / 31511 6 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492 4 / 17831 2 / 386635 -- 4 / 73492 4 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     4 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus 7 / 100203 12 / 20273 3 / 346181 -- 7 / 100203 12 / 20273 3 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 2 / 262740     -- 2 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 1 / 206823 -- 1 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 7 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 7 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904   -- -- 2 / 531904 0 / 212613