Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.29855Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 656 / 3259021 88 / 403641 981 / 25718729 16 / 491920 656 / 3259021 88 / 403641 981 / 25718729 16 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 4 / 38915 --   -- 4 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 --   -- 1 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 112 / 261599 5 / 2128 190 / 7554651 -- 112 / 261599 5 / 2128 190 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 4 / 233710   0 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum 22 / 228104 -- -- -- 22 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 9 / 51804   -- -- 9 / 51804 0 / 689 -- --
ear 8 / 39315 -- -- -- 8 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 149 / 718928 6 / 9837 179 / 2760977 -- 149 / 718928 6 / 9837 179 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 11 / 211918 -- -- -- 11 / 211918 --
eye 37 / 94929 -- 9 / 138066 -- 37 / 94929 -- 9 / 138066 --
gastrointestinal tract 19 / 34979 -- 40 / 548222 -- 19 / 34979 -- 40 / 548222 --
heart   -- 43 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 43 / 1231698 --
kidney 8 / 121184   68 / 1415985 -- 8 / 121184 0 / 2215 68 / 1415985 --
limb   -- 30 / 595880 -- 0 / 16187 -- 30 / 595880 --
liver 9 / 104633   11 / 527425 -- 9 / 104633 0 / 6685 11 / 527425 --
lung 6 / 26861 12 / 72516 68 / 943009 -- 6 / 26861 12 / 72516 68 / 943009 --
lymph node 3 / 14648 -- 3 / 344354 -- 3 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular 1 / 3137   -- -- 1 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 64 / 216846 11 / 960632 5 / 178606 8 / 85464 64 / 216846 11 / 960632 5 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 4 / 137075 -- 1 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 10 / 354066 -- 2 / 43149 -- 10 / 354066 --
pancreas 13 / 75220   101 / 1338446 -- 13 / 75220 0 / 34 101 / 1338446 --
pancreatic islet 92 / 30771 -- -- -- 92 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 8 / 145854 -- 4 / 17986 -- 8 / 145854 --
placenta 11 / 37653 -- 2 / 292212 -- 11 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate     41 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 41 / 386047 --
retina 7 / 82470 -- 18 / 636203 -- 7 / 82470 -- 18 / 636203 --
salivary gland 5 / 18434 1 / 958 -- -- 5 / 18434 1 / 958 -- --
skin 12 / 85891   34 / 615945 3 / 57574 12 / 85891 0 / 31511 34 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   6 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- -- 18 / 234473 -- -- -- 18 / 234473 --
stomach   -- 12 / 218318 -- 0 / 21241 -- 12 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   11 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 11 / 736319 --
thymus 8 / 100203   18 / 346181 -- 8 / 100203 0 / 20273 18 / 346181 --
thyroid 3 / 8821 -- -- -- 3 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 84 / 262740     -- 84 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 10 / 206823 -- 0 / 6854 -- 10 / 206823 --
vascular   -- 13 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 13 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 8 / 531904 8 / 212613 -- -- 8 / 531904 8 / 212613