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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.29580Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 435 / 3259021 4 / 403641 2938 / 25718729 3 / 491920 435 / 3259021 4 / 403641 2938 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   -- 1 / 103390 -- 0 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 108 / 261599   2561 / 7554651 -- 108 / 261599 0 / 2128 2561 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 26 / 56549 -- 80 / 233710 3 / 43127 26 / 56549 -- 80 / 233710 3 / 43127
cerebrum 43 / 228104 -- -- -- 43 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 110 / 718928   115 / 2760977 -- 110 / 718928 0 / 9837 115 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 15 / 94929 --   -- 15 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 10 / 548222 -- 0 / 34979 -- 10 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 2 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 2 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb   -- 1 / 595880 -- 0 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver 1 / 104633   1 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung     7 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 7 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 1 / 216846 1 / 960632   2 / 85464 1 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle 2 / 24130 --   -- 2 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 21 / 35780 -- -- -- 21 / 35780 -- -- --
ovary   -- 6 / 354066 -- 0 / 43149 -- 6 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   18 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 18 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 35 / 9981 -- -- -- 35 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 --   -- 3 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate     29 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 29 / 386047 --
retina 43 / 82470 -- 56 / 636203 -- 43 / 82470 -- 56 / 636203 --
salivary gland   3 / 958 -- -- 0 / 18434 3 / 958 -- --
skin 1 / 85891       1 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 5 / 234473 -- -- -- 5 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 4 / 218318 -- 3 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     4 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus     2 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 2 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740   1 / 25954 -- 8 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 13 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 13 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 15 / 531904   -- -- 15 / 531904 0 / 212613