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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.29460Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 405 / 3259021 107 / 403641 1490 / 25718729 91 / 491920 405 / 3259021 107 / 403641 1490 / 25718729 91 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 9 / 38915 -- 2 / 64924 -- 9 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 6 / 100926 -- 11 / 103390 -- 6 / 100926 -- 11 / 103390 --
brain 6 / 261599   122 / 7554651 -- 6 / 261599 0 / 2128 122 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 36 / 233710 1 / 43127 0 / 56549 -- 36 / 233710 1 / 43127
cerebrum 20 / 228104 -- -- -- 20 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 17 / 51804   -- -- 17 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 120 / 718928 6 / 9837 195 / 2760977 -- 120 / 718928 6 / 9837 195 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 9 / 211918 -- -- -- 9 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 6 / 138066 -- 2 / 94929 -- 6 / 138066 --
gastrointestinal tract 7 / 34979 -- 64 / 548222 -- 7 / 34979 -- 64 / 548222 --
heart 9 / 49793 -- 76 / 1231698 -- 9 / 49793 -- 76 / 1231698 --
kidney 19 / 121184   60 / 1415985 -- 19 / 121184 0 / 2215 60 / 1415985 --
limb 4 / 16187 -- 69 / 595880 -- 4 / 16187 -- 69 / 595880 --
liver 28 / 104633 3 / 6685 44 / 527425 -- 28 / 104633 3 / 6685 44 / 527425 --
lung 1 / 26861 18 / 72516 46 / 943009 -- 1 / 26861 18 / 72516 46 / 943009 --
lymph node   -- 12 / 344354 -- 0 / 14648 -- 12 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 22 / 85464 40 / 216846 140 / 960632 21 / 178606 22 / 85464 40 / 216846 140 / 960632 21 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 6 / 43149 -- 11 / 354066 -- 6 / 43149 -- 11 / 354066 --
pancreas 8 / 75220   67 / 1338446 -- 8 / 75220 0 / 34 67 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 7 / 145854 -- 0 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta 5 / 37653 -- 4 / 292212 -- 5 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   11 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 11 / 386047 --
retina 5 / 82470 -- 94 / 636203 -- 5 / 82470 -- 94 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891 4 / 31511 91 / 615945 10 / 57574 3 / 85891 4 / 31511 91 / 615945 10 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 5 / 73492 19 / 17831 25 / 386635 -- 5 / 73492 19 / 17831 25 / 386635 --
stem cell -- -- 16 / 234473 -- -- -- 16 / 234473 --
stomach 6 / 21241 -- 9 / 218318 -- 6 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium 6 / 16875 -- -- -- 6 / 16875 -- -- --
testis 15 / 116987 1 / 2634 55 / 736319 -- 15 / 116987 1 / 2634 55 / 736319 --
thymus 13 / 100203 15 / 20273 29 / 346181 -- 13 / 100203 15 / 20273 29 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 40 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 -- 40 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 3 / 206823 -- 1 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 33 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 33 / 1092595 --
white blood cells -- -- 100 / 398838 -- -- -- 100 / 398838 --
whole body -- -- 37 / 531904 59 / 212613 -- -- 37 / 531904 59 / 212613