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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.293175Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 163 / 3259021 18 / 403641 279 / 25718729   163 / 3259021 18 / 403641 279 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 5 / 38915 --   -- 5 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 34 / 100926 --   -- 34 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 4 / 261599   5 / 7554651 -- 4 / 261599 0 / 2128 5 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 6 / 56549 -- 1 / 233710   6 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 4 / 228104 -- -- -- 4 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 37 / 718928   28 / 2760977 -- 37 / 718928 0 / 9837 28 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 --   -- 3 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 8 / 548222 -- 1 / 34979 -- 8 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 2 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 2 / 1231698 --
kidney 2 / 121184   5 / 1415985 -- 2 / 121184 0 / 2215 5 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver   1 / 6685 1 / 527425 -- 0 / 104633 1 / 6685 1 / 527425 --
lung   6 / 72516 8 / 943009 -- 0 / 26861 6 / 72516 8 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 43 / 344354 -- 2 / 14648 -- 43 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 5 / 216846 11 / 960632   6 / 85464 5 / 216846 11 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 8 / 43149 -- 4 / 354066 -- 8 / 43149 -- 4 / 354066 --
pancreas     1 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 2 / 292212 -- 1 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate     4 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina 6 / 82470 --   -- 6 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891 6 / 31511 4 / 615945   1 / 85891 6 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492   10 / 386635 -- 3 / 73492 0 / 17831 10 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   2 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 4 / 100203   1 / 346181 -- 4 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 19 / 262740     -- 19 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 124 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 124 / 1092595 --
white blood cells -- -- 6 / 398838 -- -- -- 6 / 398838 --
whole body -- -- 5 / 531904   -- -- 5 / 531904 0 / 212613