Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.292869Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 150 / 3259021 9 / 403641 1882 / 25718729 37 / 491920 150 / 3259021 9 / 403641 1882 / 25718729 37 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   -- 5 / 103390 -- 0 / 100926 -- 5 / 103390 --
brain 6 / 261599   508 / 7554651 -- 6 / 261599 0 / 2128 508 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 14 / 233710 8 / 43127 2 / 56549 -- 14 / 233710 8 / 43127
cerebrum 62 / 228104 -- -- -- 62 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 14 / 718928   221 / 2760977 -- 14 / 718928 0 / 9837 221 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 8 / 211918 -- -- -- 8 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 14 / 138066 -- 2 / 94929 -- 14 / 138066 --
gastrointestinal tract 3 / 34979 -- 27 / 548222 -- 3 / 34979 -- 27 / 548222 --
heart   -- 64 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 64 / 1231698 --
kidney 13 / 121184   99 / 1415985 -- 13 / 121184 0 / 2215 99 / 1415985 --
limb   -- 37 / 595880 -- 0 / 16187 -- 37 / 595880 --
liver 19 / 104633 1 / 6685 41 / 527425 -- 19 / 104633 1 / 6685 41 / 527425 --
lung 1 / 26861 2 / 72516 61 / 943009 -- 1 / 26861 2 / 72516 61 / 943009 --
lymph node   -- 18 / 344354 -- 0 / 14648 -- 18 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   5 / 216846 67 / 960632 10 / 178606 0 / 85464 5 / 216846 67 / 960632 10 / 178606
muscle   -- 11 / 137075 -- 0 / 24130 -- 11 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 19 / 354066 -- 0 / 43149 -- 19 / 354066 --
pancreas     77 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 77 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 5 / 145854 -- 2 / 17986 -- 5 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 13 / 292212 -- 2 / 37653 -- 13 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate     30 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 30 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 80 / 636203 -- 1 / 82470 -- 80 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891 1 / 31511 36 / 615945 8 / 57574 1 / 85891 1 / 31511 36 / 615945 8 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     14 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 14 / 386635 --
stem cell -- -- 24 / 234473 -- -- -- 24 / 234473 --
stomach   -- 9 / 218318 -- 0 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis     87 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 87 / 736319 --
thymus 1 / 100203   27 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 27 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 9 / 262740   1 / 25954 -- 9 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 9 / 206823 -- 0 / 6854 -- 9 / 206823 --
vascular 3 / 12366 -- 125 / 1092595 -- 3 / 12366 -- 125 / 1092595 --
white blood cells -- -- 45 / 398838 -- -- -- 45 / 398838 --
whole body -- -- 85 / 531904 11 / 212613 -- -- 85 / 531904 11 / 212613