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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.292056Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 376 / 3259021 107 / 403641 1246 / 25718729 38 / 491920 376 / 3259021 107 / 403641 1246 / 25718729 38 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 11 / 38915 -- 3 / 64924 -- 11 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 54 / 100926 -- 7 / 103390 -- 54 / 100926 -- 7 / 103390 --
brain 18 / 261599   103 / 7554651 -- 18 / 261599 0 / 2128 103 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 15 / 233710 2 / 43127 5 / 56549 -- 15 / 233710 2 / 43127
cerebrum 20 / 228104 -- -- -- 20 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 9 / 51804   -- -- 9 / 51804 0 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 40 / 718928   72 / 2760977 -- 40 / 718928 0 / 9837 72 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 5 / 94929 -- 3 / 138066 -- 5 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 78 / 548222 -- 1 / 34979 -- 78 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 31 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 31 / 1231698 --
kidney 15 / 121184   41 / 1415985 -- 15 / 121184 0 / 2215 41 / 1415985 --
limb 8 / 16187 -- 19 / 595880 -- 8 / 16187 -- 19 / 595880 --
liver 21 / 104633 5 / 6685 100 / 527425 -- 21 / 104633 5 / 6685 100 / 527425 --
lung 3 / 26861 10 / 72516 77 / 943009 -- 3 / 26861 10 / 72516 77 / 943009 --
lymph node   -- 33 / 344354 -- 0 / 14648 -- 33 / 344354 --
lymphoreticular 1 / 3137 4 / 5421 -- -- 1 / 3137 4 / 5421 -- --
mammary gland 16 / 85464 25 / 216846 98 / 960632 25 / 178606 16 / 85464 25 / 216846 98 / 960632 25 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 1 / 137075 -- 3 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 5 / 354066 -- 5 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   36 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 36 / 1338446 --
pancreatic islet 7 / 30771 -- -- -- 7 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 1 / 145854 -- 1 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 6 / 37653 -- 1 / 292212 -- 6 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 14 / 99675 -- -- -- 14 / 99675 -- -- --
prostate     11 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 11 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 17 / 636203 -- 4 / 82470 -- 17 / 636203 --
salivary gland 4 / 18434   -- -- 4 / 18434 0 / 958 -- --
skin 16 / 85891 6 / 31511 180 / 615945 6 / 57574 16 / 85891 6 / 31511 180 / 615945 6 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 7 / 73492 38 / 17831 20 / 386635 -- 7 / 73492 38 / 17831 20 / 386635 --
stem cell -- -- 9 / 234473 -- -- -- 9 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 10 / 218318 -- 3 / 21241 -- 10 / 218318 --
synovium 4 / 16875 -- -- -- 4 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   11 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 11 / 736319 --
thymus 13 / 100203 18 / 20273 25 / 346181 -- 13 / 100203 18 / 20273 25 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 38 / 262740 1 / 14058 6 / 25954 -- 38 / 262740 1 / 14058 6 / 25954 --
uterus   -- 7 / 206823 -- 0 / 6854 -- 7 / 206823 --
vascular 3 / 12366 -- 145 / 1092595 -- 3 / 12366 -- 145 / 1092595 --
white blood cells -- -- 33 / 398838 -- -- -- 33 / 398838 --
whole body -- -- 47 / 531904 5 / 212613 -- -- 47 / 531904 5 / 212613