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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.29058Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 204 / 3259021 40 / 403641 775 / 25718729 17 / 491920 204 / 3259021 40 / 403641 775 / 25718729 17 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 -- 1 / 64924 -- 1 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 15 / 100926 -- 1 / 103390 -- 15 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 9 / 261599   296 / 7554651 -- 9 / 261599 0 / 2128 296 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 4 / 233710 1 / 43127 1 / 56549 -- 4 / 233710 1 / 43127
cerebrum 6 / 228104 -- -- -- 6 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 56 / 718928 1 / 9837 81 / 2760977 -- 56 / 718928 1 / 9837 81 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 2 / 138066 -- 4 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract 8 / 34979 -- 6 / 548222 -- 8 / 34979 -- 6 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 43 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 43 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   29 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 29 / 1415985 --
limb   -- 12 / 595880 -- 0 / 16187 -- 12 / 595880 --
liver 14 / 104633   16 / 527425 -- 14 / 104633 0 / 6685 16 / 527425 --
lung   11 / 72516 16 / 943009 -- 0 / 26861 11 / 72516 16 / 943009 --
lymph node   -- 3 / 344354 -- 0 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 11 / 85464 6 / 216846 32 / 960632 3 / 178606 11 / 85464 6 / 216846 32 / 960632 3 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 1 / 137075 -- 2 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 4 / 43149 -- 15 / 354066 -- 4 / 43149 -- 15 / 354066 --
pancreas 7 / 75220   39 / 1338446 -- 7 / 75220 0 / 34 39 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 3 / 145854 -- 0 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 1 / 292212 -- 2 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate 3 / 23701   8 / 386047 -- 3 / 23701 0 / 5 8 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 18 / 636203 -- 4 / 82470 -- 18 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin   1 / 31511 14 / 615945 3 / 57574 0 / 85891 1 / 31511 14 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492 14 / 17831 6 / 386635 -- 1 / 73492 14 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- -- 6 / 234473 -- -- -- 6 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 8 / 218318 -- 3 / 21241 -- 8 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 7 / 116987 2 / 2634 8 / 736319 -- 7 / 116987 2 / 2634 8 / 736319 --
thymus 6 / 100203 3 / 20273 14 / 346181 -- 6 / 100203 3 / 20273 14 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 15 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 -- 15 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 42 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 42 / 1092595 --
white blood cells -- -- 14 / 398838 -- -- -- 14 / 398838 --
whole body -- -- 27 / 531904 10 / 212613 -- -- 27 / 531904 10 / 212613