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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.290502Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 308 / 3259021 33 / 403641 423 / 25718729 4 / 491920 308 / 3259021 33 / 403641 423 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 10 / 38915 -- 3 / 64924 -- 10 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 35 / 100926 -- 1 / 103390 -- 35 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 12 / 261599 1 / 2128 101 / 7554651 -- 12 / 261599 1 / 2128 101 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 3 / 233710   3 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum 15 / 228104 -- -- -- 15 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804 1 / 689 -- -- 1 / 51804 1 / 689 -- --
ear 15 / 39315 -- -- -- 15 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 41 / 718928   67 / 2760977 -- 41 / 718928 0 / 9837 67 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye 3 / 94929 --   -- 3 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 11 / 548222 -- 0 / 34979 -- 11 / 548222 --
heart 5 / 49793 -- 23 / 1231698 -- 5 / 49793 -- 23 / 1231698 --
kidney 6 / 121184   6 / 1415985 -- 6 / 121184 0 / 2215 6 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 20 / 595880 -- 1 / 16187 -- 20 / 595880 --
liver 3 / 104633   6 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 6 / 527425 --
lung 3 / 26861 10 / 72516 13 / 943009 -- 3 / 26861 10 / 72516 13 / 943009 --
lymph node 3 / 14648 -- 6 / 344354 -- 3 / 14648 -- 6 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 11 / 85464 13 / 216846 10 / 960632   11 / 85464 13 / 216846 10 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 4 / 137075 -- 0 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous 8 / 35780 -- -- -- 8 / 35780 -- -- --
ovary   -- 4 / 354066 -- 0 / 43149 -- 4 / 354066 --
pancreas     12 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 12 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 5 / 292212 -- 2 / 37653 -- 5 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate     4 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina 8 / 82470 -- 6 / 636203 -- 8 / 82470 -- 6 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 21 / 85891 7 / 31511 6 / 615945   21 / 85891 7 / 31511 6 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 46 / 73492   6 / 386635 -- 46 / 73492 0 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium 4 / 16875 -- -- -- 4 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   10 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 10 / 736319 --
thymus 13 / 100203   6 / 346181 -- 13 / 100203 0 / 20273 6 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 27 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 -- 27 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 67 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 67 / 1092595 --
white blood cells -- -- 4 / 398838 -- -- -- 4 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904 4 / 212613 -- -- 3 / 531904 4 / 212613